2003-2015年，在中央投资带动下，经过各地共同努力，农村沼气发展进入了大发展、快发展的新阶段。截至2015年底，全国户用沼气达到4193.3万户，受益人口达2亿人；由中央和地方投资支持建成各类型沼气工程达到110975处，其中，中小型沼气工程103898处，大型沼气工程6737处，特大型沼气工程34处，工业废弃物沼气工程306处。以秸秆为主要原料的沼气工程有458处，以畜禽粪污为主要原料的沼气工程有110517处。全国农村沼气工程总池容达到1892.58万立方米，年产沼气22.25亿立方米，供气户数达到209.18万户。
2015年，中央安排预算内投资20亿元，重点支持建设了25个规模化生物天然气工程试点项目与386个规模化大型沼气工程项目，其中，25个生物天然气项目和3个特大型沼气工程日处理14888.2吨畜禽粪便（含部分冲洗水）、1411.1吨秸秆、620吨能源草、512.7吨酒糟、40吨餐厨垃圾，22.6吨果蔬或其它有机废弃物，可生产沼气102.66万立方米，提纯后生物天然气55.713万立方米，主要用作车用燃料、居民、工业用气，农村沼气转型升级工作取得较为显著成效。
在同时具备果园、菜园、茶园和畜禽养殖优势的350个（次）大县（以下简称“双优县”）中，共有大、中、小型沼气工程25688处，池容约为658万立方米，部分覆盖了果树、蔬菜和茶叶优势区域，为果（菜、茶）沼畜种养循环发展奠定了很好的基础。长期以来，各地在沼气工程建设中，将果树、蔬菜、茶叶种植与沼渣沼液消纳利用结合在一起，在种养循环方面积累了许多成功经验和做法。
全国乡村服务网点达到11.07万个、县（区）级服务站达到1140处，服务沼气用户3257.62万户，覆盖率达到74.3%，服务体系不断完善，服务能力显著提升；以沼气设计、沼气施工、沼气服务、沼气装备和“三沼”综合利用为主要内容的服务体系初步建立。
