对液化天然气运输影响较大
运河扩建之后，全球90%的液化天然气船可以通行，此前只有6%，即30%的小型液化天然气船；船只运力也从7亿立方英尺提升至39亿立方英尺。
运河扩建将大幅降低LNG船运时间及费用。
日本、韩国、中国、台湾占到全球LNG进口量的2/3。经由巴拿马运河，美国到这几个亚洲主要市场的船运时间平均缩短10天。以日本为例，此前经由非洲最南端须34天，经由苏伊士运河须31天，目前缩短到20天。
经由巴拿马运河，美国到南美的船运时间也大大缩短。到智利的再气化终端，时间从20天缩短到8-9天，到哥伦比亚和厄瓜多尔，时间从25天缩短到5天。
到东北亚的西端，包括印度和巴基斯坦，经由巴拿马运河则没有经由苏伊士运河或非洲最南端那么省时。
此外，巴拿马运河还下调了收费标准，吸引更多的LNG船只通行，尤其是往返LNG船只。一艘运力35亿立方英尺的LNG船往返通行费为0.2美元/百万英热单位（MMBtu），约占到东北亚运输成本的9-12%。
IHS数据显示，走巴拿马运河的航道，作为连接远东和美国东部地区贸易的主干道，会更有优势，比经由苏伊士运河往返平均低0.3-0.8 MMBtu，比经由非洲最南端往返平均低0.2-0.7 MMBtu。
目前美国LNG在建及待建项目产能共计92亿立方英尺/天，至2020年，美国将成为全球第三大LNG生产商，仅次于澳大利亚和卡塔尔。超过40亿立方英尺/天的美国LNG项目与亚洲市场签有长期（20年）合约，其中32亿立方英尺/天是与日本、韩国和印尼签订的。
此外，还有29亿立方英尺/天的美国LNG待建项目签订了目的地灵活的长期合约。如果这些合约都经由巴拿马运河运输，预计到2021年，每年将有超过550艘船只通过巴拿马运河，也就是1-2艘/天。
对原油成品油运输影响有限
由于石油运费、运输模式、船型等原因，巴拿马扩建对石油运输影响有限。
原油一般用30万吨超大型油船（VLCC）运输，巴拿马扩建之后还是不能通行VLCC；成品油一般用小船运输，巴拿马扩建之前大部分成品油船就可以通行。
不过运河扩建之后，除了之前运力30-50万桶的成品油船可通过，运力40-60万桶的成品油船也可通过。
通过巴拿马运河的成品油大部分是南向行驶，从大西洋到太平洋，主要是美湾出口成品油到南美洲西海岸（智利、厄瓜多尔、秘鲁等），这些国家经济发展刺激成品油需求增加，2015年美湾出口16万桶/天柴油、6.3万桶/天汽油到这三个国家，分别同比增加3.2万桶/天、2.1万桶/天；而经巴拿马运输的原油量较小，南向北向行驶的量差不多。
但需要注意的是，巴拿马运河扩建后有利于美国丙烷出口，以前美国运输到亚洲的丙烷需要过驳（ship to ship transfer），但是扩建之后，大部分运输丙烷和其他天然气制液态烃的大型液化气体船（VLGC）可以直接通过运河，可能没有必要再过驳。
